โครงการ MU Seed Grant เป็นข้อคิดริเริ่มของมหาวิทยาลัยมหิดล เพื่อสนับสนุนความร่วมมือด้านวิจัยในระยะเริ่มต้นกับพันธมิตรต่างประเทศ โดยมีวัตถุประสงค์เพื่อส่งเสริมนวัตนกรรม เสริมสร้างความร่วมมือระดับโลก และสร้างผลกระทบที่เกิดขึ้นในโลกซึ่งสอดคล้องกับการพัฒนาอย่างยั่งยืน โครงการนี้ทำหน้าที่เป็นแพลตฟอร์มในการเชื่อมโยงอาจารย์และนักวิจัยของมหาวิทยาลัยมหิดลเข้ากับนักวิจัยและสถาบันชั้นนำทั่วโลก เพื่อให้เกิดโครงการวิจัยร่วมที่ผสานความเป็นเลิศทางวิชาการเข้ากับผลกระทบที่เกิดขึ้นจริงในสังคม
โครงการดังกล่าว เปิดรับสมัครสำหรับอาจารย์และบุคลากรของมหาวิทยาลัยมหิดล (สายวิชาการ) ที่มีความร่วมมือกับนักวิจัยหรือสถาบันในต่างประเทศ โดยต้องมีหัวหน้าโครงการวิจัย (PI) อย่างน้อย 1 คน สังกัดมหาวิทยาลัยมหิดล และจะต้องมีสถาบันหรือนักวิจัยพันธมิตรต่างประเทศอย่างน้อย 1 ราย เนื่องจากวัตถุประสงค์หลักของโครงการ คือการเสริมสร้างความร่วมมือระดับโลก
โครงการที่ได้รับการสนับสนุนจะต้องแสดงให้เห็นถึงศักยภาพที่เข้มแข็งในด้านความร่วมมือระหว่างประเทศ นวัตกรรม และการมีส่วนร่วมในการพัฒนาอย่างยั่งยืน โครงการที่นำเสนอควรมีความเป็นสหวิทยาการ ส่งผลกระทบสูง และสามารถต่อยอดไปสู่ทุนภายนอกที่ใหญ่ขึ้น หรือสร้างความร่วมมือระยะยาวได้
ระดับงบประมาณสนับสนุนขึ้นอยู่กับมหาวิทยาลัยพันธมิตร และจะมีการประกาศให้ทราบในแต่ละรอบของการเปิดรับข้อเสนอโครงการ ระยะเวลาการให้ทุนโดยทั่วไปคือ 12 เดือน นับจากวันที่เริ่มต้นโครงการ โดยอาจมีการปรับเปลี่ยนได้ตามความจำเป็นของโครงการ ทุนนี้ครอบคลุมค่าใช้จ่ายในการทำวิจัย การเก็บข้อมูลภาคสนาม การจัดเวิร์กช็อป การเดินทาง/การเยือนเพื่อแลกเปลี่ยน (Mobility) และกิจกรรมการแบ่งปันความรู้ โดยทั่วไปจะไม่รวมเงินเดือนบุคลากร